Если обратиться к первоисточнику
Цитата: 1.Застрахованные лица - лица, на которых распространяется обязательное пенсионное страхованиев соответствии с настоящим Федеральным законом. Застрахованными лицами являются граждане Российской Федерации, постоянно или временно проживающие на территории Российской Федерации иностранные граждане или лица без гражданства, а также иностранные граждане или лица без гражданства (за исключением высококвалифицированных специалистов в соответствии с Федеральным законом от 25 июля 2002 года N 115-ФЗ "О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации"), временно пребывающие на территории Российской Федерации:работающие по трудовому договору,в том числе руководители организаций, являющиеся единственными участниками (учредителями), членами организаций, собственниками их имуществаили по договору гражданско-правового характера, предметом которого являются выполнение работ и оказание услуг
то можно сделать вывод, что по отношению к организации, с которой человек не состоит в трудовых отношениях, он не является застрахованным (Вы не являетесь его страхователем), поэтому сведения на него подавать не надо ни по форме СЗВ-М, ни в разделе 3. Но раз уж по ошибке его включили в раздел 3 и показали, что он является застрахованным (в строке 160 = 1), то чтобы исправить ошибку, надо указать, что он не является застрахованным (стр.160 =2).
Другого варианта исправления на сегодняшний день я не вижу. Вот с 2018 года планируется ввести тип корректировки "отменяющая", тогда будет однозначное решение проблемы.